Эта фича определяет систему инициализации, которая будет использована в пользовательской среде (livecd, установленный дистрибутив, vm). Она не влияет на состав инсталятора и rescue-образа. Обратите внимание: как и с use/bootloader/%, в силу особенностей make переключение в каждую позицию возможно лишь один раз, далее эта цель считается достигнутой и при последующих вызовах не отрабатывает. См. тж.: http://altlinux.org/sysvinit http://altlinux.org/systemd